This is a list of lakes of the Czech Republic, larger than 1 ha, sorted by area.
| Lake | District | Area ha | Depth m | Altitude m | River (Drainage basin) | |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 51.0 | 3.0 | 377 | Loděnice | |||
| 18.4 | 40.6 | 1,008 | Černý potok (Úhlava) | |||
| 16.3 | 3.3 | 337 | (Bílina) | |||
| Klatovy | 10.3 | 37 | 1,030 | Jezerní potok (Železný potok) | ||
| 7.48 | 18.3 | 1,090 | Jezerní potok (Vltava – Lipno Dam) | |||
| 4.5 | 6.7 | 413 | Mladotický potok (Střela) | |||
| Klatovy | 3.7 | 15 | 1,080 | Jezerní potok (Prášilský potok – Křemelná) | ||
| Klatovy | 2.53 | 3.9 | 1,096 | Jezerní potok (Černý potok – Křemelná) | ||
| Plzeň-North | ~2 | 18 | 337 | (Třemošná) | ||
| Prachatice | 1.3 | 7 | 908 | (Teplá Vltava) |